Program regionalno pomirenje kao svoje primarne ciljeve ima razvijanje kritičkog odnosa prema ratnoj prošlosti, razvijanje kulture dijaloga, podsticanje tolerancije i solidarnosti, kao i razvijanje svesti o ravnoteži između prava i odgovornosti. Ovim ciljevima Institut pristupa kroz aktivnosti i baveći se temama kao što su suočavanje s prošlošću, promocija mira, međunarodna saradnja i analiza formalnog obrazovanja.
U fokusu rada Instituta za evropske poslove je praćenje pregovora Srbije sa EU i jačanje kapaciteta svih uključenih u procesu. Imajući u vidu složenost i dugotrajnost ovog procesa, Institut okuplja veliki broj stručnih saradnika sa kojima organizuje treninge, debate i druga usavršavanja zato što želimo da svojim radom doprnesemo boljem razumevanju evroatlantskih integracija. Institut radi na organizovanju treninga i pružanju multiperspektivnih informacija kako bismo omogućili aktivno učešće stručne javnosti i građana u procese donošenja odluka. Institut aktivno zagovara i zalaže se za temeljne reforme u okviru pegovaračkog procesa i u saradnji sa partnerima jačamo kapacitete Srbije da se suoči sa izazovima u globalnom svetu kroz zajedničko delovanje, koje za krajnji cilj ima aktivno članstvo Srbije u evroatlantskim okvirima za dobrobit svih građana.
